药学专业为学校最早开办的专业之一。自上世纪70年代起，即开始为部队和地方培养各类药学人才。1981年起，开始为部队培养专科人才，2001年起开办全日制药学本科专业，2006年获得学士学位授予权， 2006年药物制剂本科专业获批并于同年招生；2018年中药学本科专业获批招生。现有药学、药物制剂、中药学三个本科专业，年招生人数约400人，其中药学专业被评为四川省高等本科特色专业、省一流本科建设专业。2023年被列为四川省“贡嘎计划”双一流学科建设点。

学院现有教职工80人，其中，专任教师65人，博士44人，高级专业技术人员34人。学院享受国务院政府特殊津贴1人，省级学术技术带头人及后备人选22人，四川省天府峨眉计划青年人才1人，省教学名师1人，四川省有突出贡献的优秀专家1人，四川省特聘专家1人，留学归国人员7人，双师型师资17人。

学院拥有四川省高校重点实验室1个，四川省实验教学示范中心1个，国家中医药管理局二级实验室1个，“基于药品研发全产业链”的创新创业教育平台1个。拥有分析测试平台、药物新剂型研究与制剂开发平台、药物合成研究平台、中药品种品质与资源开发研究平台、药理学研究平台。实验室面积约3500余平方米，建有25间设施设备配套、功能齐全的教学科研实验室,拥有仿真实验室、中药标本室，教学科研实验室、自习室，学术会议室等。

学院坚持产教融合、校企联合培养特色，培养了一大批“下得去、留得住、用的上”的行业基层岗位人才，学院已先后培养军地毕业生5000余名，近三年来平均就业率为87%。自加入全国高考统一招生后，生源素质不断提高，目前药学专业在全国16个省市招生。多数用人单位认为学院培养的毕业生动手能力强，能吃苦，有较好的团队合作精神。随着毕业生在省内医药行业就业人数的不断增加，学校的人才培养质量也被越来越多的用人单位所认可，学校药学类人才培养的知名度正在不断地增加。

近年来，在药学院党委的领导下，药学学科在师资队伍、研究平台建设等方面有了长足的进步，以产教融合为主要途径开展人才培养及科学研究，药学专硕教育在案例教学、校企联合培养等方面在全国产生了一定的影响力。学院将秉承“博学笃行、精药济世”院训，继续坚持学校的高素质应用型人才培养的办学定位，瞄准行业需求，深化产教融合，培养高素质应用型人才，服务于区域医药卫生事业发展。